حتى عام 1961 كان القسم يشغل الطابق الأرضي لدار التوليد القديم في المستشفى الوطني وهو تابع لإدارة المستشفى الوطني التي تشمل جميع أقسام كلية الطب، وكان عدد الأسرة 27 سريراً وكانت هناك عيادة صباحية تنتهي ظهرا والإسعاف مشترك مع إسعاف المست وشفى الوطني. وكان في القسم حينها ثلاثة أعضاء هيئة تدريسية هم: جميل سالم (محاضر) – سهيل بدورة (مدرس) – منذر شيخ الحدادين (قائم بالأعمال السريرية، معيد).
في عام 1962-1977: توسع القسم وانتقل إلى بناء المستشفى الوطني القديم مع بقائه تابعا لإدارة المستشفى الوطني، وكان عدد الأسرة 50 سريراً وحاضنتان كانتا توزعان على الغرف حسب العمر ثم حدث توسع حيث أضيفت غرفتان للوليد والخديج فأصبح عدد الأسرة 50 سريرا و8 حاضنات و4 أسرة لحديثي الولادة، وأصبح للقسم عيادة خاصة تحتوي على غرف 6 غرف لفحص المرضى إضافة لاستمرار العمل فيها لاستقبال الإسعاف على مدار 24 ساعة. وازداد عدد أعضاء الهيئة التدريسية ليصبح ثمانية عشر عضوا معظمهم يحمل اختصاصات دقيقة. وتضاعف عدد المقيمين، وفي عام 1972- 1973 استبدل نظام المقيمين بنظام الدراسات العليا الذي يتم فيه التدريب لثلاثة سنوات من اجل منح ماجستير في طب الأطفال وقد كانت الدفعة الأولى من الخريجين عام 1975.
وفي عام 1978-2004 توسع القسم بانتقاله لمستشفى أطفال جامعة دمشق، وأصبح مستقلا بإدارته، ونظامه، وموازنته. حيث أصبح يدار من قبل رئيس قسم الأطفال ومجلس القسم إضافة إلى مجلس إدارة المستشفى يرأسه رئيس قسم الأطفال، وأعضاؤه هم رئيس الأطباء ورؤساء الشعب (معظمهم من الهيئة التدريسية) إضافة للمدير العام ومعاونه ورئيسة التمريض، وأصبح عدد الأسرة 384 سريراً، وتوسع بافتتاح الإقامة المؤقتة بحيث أصبح عددالأسرة 384 سريرا مع بناء مستقل للعيادة العامة، والعيادة التخصصية والإسعاف.
أما أعضاء الهيئة التدريسية فأصبح 23 عضو هيئة تدريسة و 12 معيد وتسعة أطباء.
تدرس مادة الأطفال لطلاب السنة الرابعة لطلاب كلية الطب جامعة دمشق، وذلك عن طريق كتاب جامعي يقدم موجزا عن الطفل الطبيعي، وأمراض الوليد، والعناية بالخدج والولدان، إلى العناية بالطفل وأهم أمراض الأطفال. وقد شارك بتأليف الكتاب معظم أعضاء الهيئة التدريسية، ويتم تدريب طلاب السنة الخامسة والسادسة في مستشفى الأطفال بطريقة حديثة حيث يتوزع الطلاب إلى مجموعات صغيرة ويشارك في تدريبهم جميع أعضاء الهيئة التدريسية إضافة للأطباء الاختصاصيين في مستشفى الأطفال.
يداوم في مشفى الأطفال المقيمين حيث بلغ عددهم /140/ طالب دراسات عليا وبورد عربي موزعين على 4 سنوات وعدد من المتدربين من وزارات اخرى. ويشمل البرنامج التعليمي نادي المجلات،وجلسة علمية اسبوعية لجميع شعب القسم. ومنذ عام 1993 ينظم مستشفى الأطفال مؤتمر سنوي يقدم فيه بعض ما أنجز من أبحاث في المستشفى إضافة إلى محاضرات تثقيفية من محاضرين محليين وأجانب للحصول على درجة الدكتوراه في بعض الاختصاصات الفرعية (أمراض الوليد – الأمراض الانتاينة – أمراض الدم والأورام)، وقد زاد عدد الخريجين اللذين حصلوا على درجة الماجستير عن الثلاثمائة طبيب أطفال موزعين على جميع محافظات القطر وهم من خيرة أطباء الأطفال ذوي الكفاءة العالية. كما يقوم القسم بتدريس تمريض الطفل، وتمريض الوليد والخديج لطالبات مدرسة التمريض في جامعة دمشق.